生醫所所長綜理所內各項學術及行政職掌，並由二位資深研究員擔任副所長以協助處理業務。所內亦成立各種委員會，處理並評估相關事務，重大議案則在所務會議中進行討論及表決。生醫所的專業支援人員在行政室、總務室、安全室、電腦室及美工室，協助處理各項例行性業務。